##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“rtracklayer”)

这个包适用于Bioconductor的2.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见rtracklayer．

R接口到基因组浏览器及其注释跟踪

Bioconductor版本:2.8

可扩展的框架，用于与多个基因组浏览器交互(目前内置UCSC)，并以各种格式操作注释轨道(目前内置GFF、BED、bedGraph、BED15和WIG)。用户可以从受支持的浏览器中导出/导入曲目，以及查询和修改浏览器状态，例如当前的视口。

作者:迈克尔·劳伦斯，文斯·凯里，罗伯特·绅士

维护者:Michael Lawrence

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“rtracklayer”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rtracklayer”)

PDF		rtracklayer.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释，DataImport，软件，可视化
版本	1.12.5
在Bioconductor	BioC 2.2 (R-2.7)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.7.0)，方法，RCurl(> = 1.4 - 2)
进口	XML(1.98 > = 0),IRanges(> = 1.9.26),GenomicRanges(> = 1.1.34),Biostrings(> = 2.15.22),BSgenome(> = 1.15.17)
链接	IRanges
建议	humanStemCell，微(> = 1.1.1),genefilter，limma，org.Hs.eg.db，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	EatonEtAlChIPseq，GGtools
进口我	ChromHeatMap，geneLenDataBase，GenomicFeatures，GGtools，R453Plus1Toolbox
建议我	GenomicFeatures，GGtools，ind1KG，马赛克，MotIV，oneChannelGUI，图片，R453Plus1Toolbox，林格，rMAT
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	rtracklayer_1.12.5.tar.gz
Windows二进制	rtracklayer_1.12.5.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/rtracklayer/tree/release-2.8
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rtracklayer/
软件包下载报告	下载数据