要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的2.8版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109.
Bioconductor版本:2.8
从NCBI dbSNP Build 132中提取的智人SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2010年11月9日创建,包含映射到参考基因组GRCh37的snp。警告:注意,除了线粒体染色体外,GRCh37基因组与UCSC的hg19基因组相同。因此,该包中的snp可以被“注入”到bsgome . hsapiens . ucsc中。hg19,但此注入将排除chrM(即在该序列中不会注入任何东西)。
作者:Herve Pages
维护人员:H. Pages
引用(从R中,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109")
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens |
版本 | 0.99.2 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | IRanges,GenomicRanges |
进口 | 方法,IRanges,GenomicRanges |
链接 | |
建议 | Biostrings,BSgenome(> = 1.16.1),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | ceu1kg,cheung2010 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109_0.99.2.tar.gz |
Windows二进制 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109_0.99.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Mac OS X 10.9(小牛队) | |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109/ |
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