要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109

此包适用于Bioconductor的2.8版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109

智人的SNP位点(dbSNP Build 132)

Bioconductor版本:2.8

从NCBI dbSNP Build 132中提取的智人SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2010年11月9日创建,包含映射到参考基因组GRCh37的snp。警告:注意,除了线粒体染色体外,GRCh37基因组与UCSC的hg19基因组相同。因此,该包中的snp可以被“注入”到bsgome . hsapiens . ucsc中。hg19,但此注入将排除chrM(即在该序列中不会注入任何东西)。

作者:Herve Pages

维护人员:H. Pages

引用(从R中,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109")

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData遗传学Homo_sapiens
版本 0.99.2
许可证 艺术- 2.0
取决于 IRangesGenomicRanges
进口 方法,IRangesGenomicRanges
链接
建议 BiostringsBSgenome(> = 1.16.1),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 ceu1kgcheung2010

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109_0.99.2.tar.gz
Windows二进制 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109_0.99.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(小牛队)
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109/
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