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DiffBind
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这个包是2.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DiffBind。
微分绑定ChIP-Seq峰值数据的分析
Bioconductor版本:2.9
计算不同绑定网站从多个ChIP-seq实验使用亲和力(定量)数据。还使入住率(重叠)分析和绘图功能。
作者:罗里鲜明的<罗里。斯塔克在cancer.org.uk >,Gordon Brown
维护人员:罗里鲜明的<罗里。斯塔克在cancer.org.uk >
从内部引用(R,回车引用(“DiffBind”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“DiffBind”)
文档
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| DiffBind.pdf | ||
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 生物信息学,ChIPseq,HighThroughputSequencing,软件 |
| 版本 | 1.0.9 |
| Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.14.0) |
| 进口 | RColorBrewer,北极监测和评估方案,刨边机(> = 2.3.58),gplots,limma,DESeq,统计grDevices跑龙套,IRanges,zlibbioc |
| 链接 | Rsamtools |
| 建议 | DESeq |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | rgl、并行 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | DiffBind_1.0.9.tar.gz |
| Windows二进制 | DiffBind_1.0.9.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
| Mac OS X 10.9(小牛) | |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/diffbind/tree/release - 2.9 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DiffBind/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
