要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“GOSemSim”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GOSemSim

这个包适用于Bioconductor 2.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见GOSemSim

语义相似性度量

Bioconductor版本:2.9

分别实现了Resnik、Schlicker、Jiang、Lin和Wang提出的5种GO语义相似度估计方法。支持许多物种,包括按蚊,拟南芥,牛,犬,鸡,黑猩猩,大肠杆菌菌株K12和酒井,苍蝇,人类,疟疾,老鼠,猪,恒河猴,大鼠,蠕虫,非洲爪蟾,酵母和斑马鱼。

作者:余光创

维护人员:guangchuangyu

引文(从R内,输入引用(“GOSemSim”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“GOSemSim”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GOSemSim”)

PDF GOSemSim.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学聚类通路软件
版本 1.12.1
在Bioconductor BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证 GPL-2
取决于 剂量, r (>= 2.10)
进口 方法,AnnotationDbiGO.dborg.Hs.eg.dborg.Ag.eg.dborg.At.tair.dborg.Bt.eg.dborg.Ce.eg.dborg.Cf.eg.dborg.Dm.eg.dborg.Dr.eg.dborg.EcK12.eg.dborg.EcSakai.eg.dborg.Gg.eg.dborg.Mm.eg.dborg.Mmu.eg.dborg.Pf.plasmo.dborg.Pt.eg.dborg.Rn.eg.dborg.Sc.sgd.dborg.Sco.eg.dborg.Ss.eg.dborg.Xl.eg.db
链接
建议 clusterProfiler
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 clusterProfiler剂量
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 GOSemSim_1.12.1.tar.gz
Windows二进制 GOSemSim_1.12.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GOSemSim/tree/release-2.9
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GOSemSim/
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