##尝试http:// if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite(" genome icfeatures ")

此包适用于Bioconductor的2.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GenomicFeatures．

用于制作和操作以文本为中心的注释的工具

Bioconductor版本:2.9

一组用于制作和操作以文本为中心的注释的工具和方法。有了这些工具，用户可以轻松地从UCSC基因组浏览器或BioMart数据库(未来将支持更多来源)下载给定生物体的转录本、外显子和cd的基因组位置。然后，这些信息被存储在一个本地数据库中，该数据库跟踪记录了转录本、外显子、cd和基因之间的关系。为以方便的格式提取所需的特征提供了灵活的方法。

作者:M. Carlson, H. Pages, P. Aboyoun, S. Falcon, M. Morgan, D. Sarkar, M. Lawrence

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http:// if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite(" genome icfeatures ")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GenomicFeatures”)

PDF		GenomicFeatures.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释，遗传学，HighThroughputSequencing，基础设施，软件
版本	1.6.9
Bioconductor自	BioC 2.5 (R-2.10)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	IRanges(> = 1.11.34),GenomicRanges(> = 1.5.42),AnnotationDbi(> = 1.15.39)
进口	方法,DBI(> = 0.2 5),RSQLite(> = 0.8 1),IRanges，GenomicRanges，Biostrings(> = 2.17.6),rtracklayer(> = 1.13.14),biomaRt，RCurl跑龙套,Biobase
链接
建议	rtracklayer，biomaRt，org.Mm.eg.db，Biostrings，BSgenome，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18(> = 1.3.14),BSgenome.Celegans.UCSC.ce2，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	ggtut，TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart10，TxDb.Celegans.UCSC.ce6.ensGene，TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene，TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn4.ensGene，TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer2.ensGene，TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer2.sgdGene
进口我	geneLenDataBase，ggbio，TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart10，TxDb.Celegans.UCSC.ce6.ensGene，TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene，TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn4.ensGene，TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer2.ensGene，TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer2.sgdGene，VariantAnnotation
建议我	Biostrings，biovizBase，chipseq，GenomicRanges，ggtut，ind1KG，Rsamtools，ShortRead
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	GenomicFeatures_1.6.9.tar.gz
Windows二进制	GenomicFeatures_1.6.9.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(小牛队)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/GenomicFeatures/tree/release-2.9
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GenomicFeatures/
包下载报告	下载数据