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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“GlobalAncova”)

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GlobalAncova

这个包是2.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GlobalAncova

计算全球测试组间差异基因表达

Bioconductor版本:2.9

我们给下面的参数支持GlobalAncova方法:适当的正常化后,基因表达数据出现,而对称和离群值没有真正的问题,所以最小二乘应该相当强劲。ANCOVA交互产生饱和数据建模如不同意味着每组和基因。协变量调整可以帮助纠正可能选择偏见。残差方差同质性和不相关的无法预期。普通最小二乘法的应用给予公正的,但不再最优估计(Gauss-Markov-Aitken)。因此,使用经典的野生是不合适的,由于相关性。然而镜子偏离零假设检验统计量。结合一个排列方法,实证意义可以近似水平。另外,一个近似收益率渐近假定值。这项工作是支持的NGFN格兰特01 GR 0459年,德国BMBF。

作者:美国Mansmann, r·迈斯特·m·胡默尔r . Scheufele s Knueppel的贡献

维护人员:曼胡默尔<曼。无角的在crg.eu >

从内部引用(R,回车引用(“GlobalAncova”)):

安装

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文档

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PDF GlobalAncova.pdf
PDF GlobalAncovaDecomp.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学,DifferentialExpression,微阵列,OneChannel,通路,软件
版本 3.22.0
Bioconductor自 BioC 1.7 (r - 2.2)(10.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 方法,corpcor,globaltest
进口 注释,AnnotationDbi
链接
建议 Biobase,注释,GO.db,KEGG.db,golubEsets,hu6800.db,vsn,GSEABase,Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 GlobalAncova_3.22.0.tar.gz
Windows二进制 GlobalAncova_3.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/globalancova/tree/release - 2.9
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GlobalAncova/
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弗雷德哈钦森癌症研究中心