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SPIA
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这个包是2.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SPIA。
信号通路影响分析(SPIA)使用途径代表的证据和不寻常的信号干扰
Bioconductor版本:2.9
这个包实现了信号通路影响分析(SPIA)使用差异表达基因的信息形成一个列表和他们的日志褶皱与信号通路的拓扑变化,为了识别途径最相关条件下的研究。
作者:Adi Laurentiu Tarca < atarca med.wayne.edu >, Purvesh Kathri < Purvesh cs.wayne.edu >和索林Draghici <索林wayne.edu >
维护人员:Adi Laurentiu Tarca < atarca med.wayne.edu >
从内部引用(R,回车引用(“SPIA”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“SPIA”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SPIA”)
| SPIA.pdf | ||
| 参考手册 |
细节
| biocViews | GraphsAndNetworks,微阵列,软件 |
| 版本 | 测试盒框 |
| Bioconductor自 | BioC 2.4 (r - 2.9)(7年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(> = 2.8.0),图形 |
| 进口 | 图形 |
| 链接 | |
| 建议 | 图,Rgraphviz,KEGGgraph,hgu133plus2.db |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btn577v1 |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 石墨,KEGGgraph |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | SPIA_2.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SPIA_2.4.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
| Mac OS X 10.9(小牛) | |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/spia/tree/release - 2.9 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SPIA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
