要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("annotate")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

注释

此包适用于Bioconductor的2.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见注释

微阵列注释

Bioconductor版本:2.9

使用R环境进行注释。

作者:R.绅士

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

引用(从R中,输入引用(“注释”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("annotate")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“注释”)

PDF annotate.pdf
PDF chromLoc.pdf
PDF GOusage.pdf
PDF prettyOutput.pdf
PDF query.pdf
PDF useDataPkgs.pdf
PDF useHomology.pdf
PDF useProbeInfo.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 注释通路软件
版本 1.32.3
在Bioconductor公司 BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 11年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.4.0),AnnotationDbi(> = 0.1.15)
进口 BiobaseAnnotationDbiDBIxtable,图形,工具,统计,方法
链接
建议 Biobasehgu95av2.dbgenefilterBiostrings(> = 2.4.4),rae230a.dbrae230aprobetkWidgetsXML(> = 0.92 2),GO.dborg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dbhom.Hs.inp.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 Agi4x44PreProcessChromHeatMapGeneAnswersgeneplotterGGtoolsGSEABase染色体组型macatMLInterfacesNeve2006ontoToolsPCphenophenoTestPREDAPREDAsampledataRpsiXML安全ScISI
进口我 affycoretools类别ChromHeatMapcodelinkGeneAnswersgenefiltergeneplotterGlobalAncovaglobaltestGOstatsGSEABase光民methylumiphenoTestqpgraph安全ScISIsplicegeartigre
建议我 adme16cod.dbag.dbath1121501.dbBiocCaseStudiesbiomaRtbovine.dbcanine.dbcanine2.dbcelegans.dbchicken.dbdrosgenome1.dbdrosophila2.dbecoli2.dbgeneplotterGGHumanMethCancerPanelv1.dbGlobalAncovaglobaltestGOstatsGSEAlmh10kcod.dbh20kcod.dbhcg110.dbhgfocus.dbhgu133a.dbhgu133a2.dbhgu133b.dbhgu133plus2.dbhgu219.dbhgu95a.dbhgu95av2.dbhgu95b.dbhgu95c.dbhgu95d.dbhgu95e.dbhguatlas13k.dbhgubeta7.dbhguDKFZ31.dbhgug4100a.dbhgug4101a.dbhgug4110b.dbhgug4111a.dbhgug4112a.dbhguqiagenv3.dbhi16cod.dbhs25kresogen.dbHs6UG171.dbHsAgilentDesign026652.dbhthgu133a.dbhthgu133b.dbhu35ksuba.dbhu35ksubb.dbhu35ksubc.dbhu35ksubd.dbhu6800.dbhugene10stprobeset.dbhugene10sttranscriptcluster.dbhugene11stprobeset.dbhugene11sttranscriptcluster.dbHuO22.dbhwgcod.dbIlluminaHumanMethylation27k.dbIlluminaHumanMethylation450k.dbilluminaHumanv1.dbilluminaHumanv2.dbilluminaHumanv2BeadID.dbilluminaHumanv3.dbilluminaHumanv4.dbilluminaHumanWGDASLv3.dbilluminaHumanWGDASLv4.dbilluminaMousev1.dbilluminaMousev1p1.dbilluminaMousev2.dbilluminaRatv1.dbindac.dbJazaeriMetaData.dbLAPOINTE.dblumiHumanAll.dblumiMouseAll.dblumiRatAll.dbm10kcod.dbm20kcod.dbmaigesPackmgu74a.dbmgu74av2.dbmgu74b.dbmgu74bv2.dbmgu74c.dbmgu74cv2.dbmguatlas5k.dbmgug4104a.dbmgug4120a.dbmgug4121a.dbmgug4122a.dbmi16cod.db中长期规划mm24kresogen.dbMmAgilentDesign026655.dbmoe430a.dbmoe430b.dbmogene10stprobeset.dbmogene10sttranscriptcluster.dbmogene11stprobeset.dbmogene11sttranscriptcluster.dbmouse4302.dbmouse430a2.dbmpedbarray.dbmu11ksuba.dbmu11ksubb.dbMu15v1.dbmu19ksuba.dbmu19ksubb.dbmu19ksubc.dbMu22v3.dbmwgcod.dbNorway981.dbnugohs1a520180.dbnugomm1a520177.dboneChannelGUIOperonHumanV3.dborg.Ag.eg.dborg.At.tair.dborg.Bt.eg.dborg.Ce.eg.dborg.Cf.eg.dborg.Dm.eg.dborg.Dr.eg.dborg.EcK12.eg.dborg.EcSakai.eg.dborg.Gg.eg.dborg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dborg.Mmu.eg.dborg.Pf.plasmo.dborg.Pt.eg.dborg.Rn.eg.dborg.Sc.sgd.dborg.Sco.eg.dborg.Ss.eg.dborg.Xl.eg.dbPartheenMetaData.dbpedbarrayv10.dbpedbarrayv9.dbPOCRCannotation.dbporcine.db彪马r10kcod.dbrae230a.dbrae230b.dbragene10stprobeset.dbragene10sttranscriptcluster.dbragene11stprobeset.dbragene11sttranscriptcluster.dbrat2302.dbrgu34a.dbrgu34b.dbrgu34c.dbrguatlas4k.dbrgug4105a.dbrgug4130a.dbrgug4131a.dbri16cod.dbRnAgilentDesign028282.dbrnu34.dbRoberts2005Annotation.dbrtu34.dbrwgcod.dbSHDZ.dbsiggenestigreu133x3p.dbxlaevis.dbyeast2.dbygs98.dbzebrafish.db
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 annotate_1.32.3.tar.gz
Windows二进制 annotate_1.32.3.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(小牛队)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/annotate/tree/release-2.9
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/annotate/
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