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eisa
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这个包是2.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅eisa。
通过迭代签名算法表达数据分析
Bioconductor版本:2.9
迭代签名算法(ISA)是一个biclustering方法;找到相关的块(转录模块)基因表达的数据(或其他表格)。ISA能够找到重叠模块和噪音是有弹性的。这个包提供了一个方便的ISA接口,使用标准BioConductor数据结构;也包含各种可视化工具,可以用于其他biclustering算法。
作者:伽柏Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >
维护人员:伽柏Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(eisa)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (eisa)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (eisa)
| EISA_biclust.pdf | ||
| EISA_tutorial.pdf | ||
| ISA_internals.pdf | ||
| tissues.pdf | ||
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 分类,GeneExpression,微阵列,软件,可视化 |
| 版本 | 1.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.6 (r - 2.11)(6年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | 方法,isa2,Biobase,AnnotationDbi,类别,genefilter,DBI |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | igraph(> = 0.5.5),矩阵,GOstats,GO.db,KEGG.db,biclust,质量,xtable,所有,hgu95av2.db |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | ExpressionView |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | eisa_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | eisa_1.6.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
| Mac OS X 10.9(小牛) | |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/eisa/tree/release - 2.9 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/eisa/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
