##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“gage”)

这个包适用于Bioconductor 2.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见计．

途径分析的一般适用基因集富集

Bioconductor版本:2.9

GAGE是一种已发表的基因集或通路分析方法。GAGE通常适用于独立于微阵列数据属性，包括样本量、实验设计、微阵列平台和其他类型的异质性，并且始终优于其他常用方法。在gage包中，我们提供了基本gage分析、结果处理和表示的功能。我们还建立了一批多个GAGE分析的管道例程，并行分析之间的比较，以及来自不同来源/研究的异质数据的组合分析。此外，我们还提供了基于KEGG通路和GO术语的演示微阵列数据和常用基因集数据。这些功能和数据对于使用其他方法进行基因集分析也很有用。

作者:罗维钧

维护者:Weijun Luo < Luo Weijun at yahoo.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“gage”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“规”)

PDF		gage.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学，DataRepresentation，DifferentialExpression，去，遗传学，微阵列，MultipleComparisons，OneChannel，通路，RNAseq，软件，TwoChannel
版本	测试盒框
在Bioconductor	BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2.0)
取决于	图，乘
进口
链接
建议	gageData，GO.db，GSEABase，KEGG.db，org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.biomedcentral.com/1471-2105/10/161
全靠我
进口我
建议我	gageData
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	gage_2.4.0.tar.gz
Windows二进制	gage_2.4.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/gage/tree/release-2.9
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/gage/
软件包下载报告	下载数据