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这个包适用于Bioconductor 2.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见girafe．

用于功能探索的基因组间隔和读取比对

Bioconductor版本:2.9

“girafe”包处理下一代测序数据中对齐读取的基因组水平表示。它包含一个对象类，用于实现基因组间隔的详细描述与对齐的读取和函数比较，可视化，导出和使用这些间隔和对齐的读取。因此，这个包与ShortRead、IRanges和genomeinterval包进行交互，并在它们之间提供链接。

作者:Joern Toedling，由Constance Ciaudo, Olivier Voinnet, Edith Heard, Emmanuel Barillot和Wolfgang Huber贡献

维护者:j.蹒跚蹒跚学步

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“girafe”)

PDF		girafe.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	HighThroughputSequencing，测序，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.10.0)，方法，IRanges(> = 1.3.53),Rsamtools，ShortRead(> = 1.3.21),时间间隔(> = 0.13.1),genomeIntervals(>= 1.7.3)，网格
进口	方法,Biobase，Biostrings，BSgenome，图形，grDevices，统计，utils，IRanges
链接
建议	质量，org.Mm.eg.db，RColorBrewer
SystemRequirements
增强了	genomeIntervals
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	girafe_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	girafe_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/girafe/tree/release-2.9
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/girafe/
软件包下载报告	下载数据