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这个包适用于Bioconductor 2.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见光民．

用于Illumina甲基化和表达微阵列的BeadArray特定方法

Bioconductor版本:2.9

lumi包为Illumina微阵列数据分析提供了一个集成的解决方案。它包括Illumina BeadStudio (genome estudio)数据输入、质量控制、beadarray特定方差稳定、归一化和探针级基因注释功能。介绍了Illumina甲基化微阵列的加工功能，特别是Illumina Infinium甲基化微阵列的加工功能。

作者:潘杜，冯刚，Warren Kibbe, Simon Lin

维护者:Pan Du

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“光民”)

PDF		Bioc2007_lumi_presentation.pdf
PDF		IlluminaAnnotation.pdf
PDF		lumi.pdf
PDF		lumi_VST_evaluation.pdf
PDF		methylationAnalysis.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	DNAMethylation，微阵列，OneChannel，预处理，质量控制，软件，TwoChannel
版本	2.6.0
在Bioconductor	BioC 2.0 (R-2.5)(9年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.4.0)，methylumi(> = 1.7.4),Biobase(> = 2.5.5),nleqslv
进口	affy(> = 1.23.4),methylumi，注释，Biobase(> = 2.5.5),mgcv(1.4 > = 0),hdrcde，KernSmooth，preprocessCore，RSQLite，DBI，AnnotationDbi，质量，图形，统计，方法
链接
建议	GeneAnswers，beadarray，limma，vsn，lumiBarnes，lumiHumanAll.db，lumiHumanIDMapping，genefilter，RColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	arrayMvout，ffpeExampleData，lumiBarnes，lumiHumanIDMapping，lumiMouseIDMapping，lumiRatIDMapping，MAQCsubset，MAQCsubsetILM，mvoutData
进口我
建议我	beadarray，methylumi，tigre
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	lumi_2.6.0.tar.gz
Windows二进制	lumi_2.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/lumi/tree/release-2.9
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/lumi/
软件包下载报告	下载数据