要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“macat”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

macat

这个包适用于Bioconductor 2.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见macat

微阵列染色体分析工具

Bioconductor版本:2.9

这个文库包含功能,以调查差异基因表达和基因的染色体定位之间的联系。MACAT的动机是对肿瘤细胞中涉及大染色体区域的常见现象的观察。MACAT是用于识别显著差异表达的染色体区域的统计方法的实施。这些函数已经在一个关于急性淋巴细胞白血病(Yeoh et al.Cancer Cell 2002)的公开数据集上进行了测试,该数据集在“stjudem”库中提供。

作者:Benjamin Georgi, Matthias Heinig, Stefan Roepcke, Sebastian Schmeier, Joern Toedling

维护者:Joern Toedling 蹒跚学步

引文(从R内,输入引用(“macat”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“macat”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“macat”)

PDF chrom6T.pdf
PDF chrom6TkNN.pdf
PDF evalkNN6.pdf
PDF macat.pdf
PDF Slidingchrom6s3.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpression微阵列软件可视化
版本 1.28.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Biobase注释
进口
链接
建议 hgu95av2.dbstjudem
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 macat_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 macat_1.28.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/macat/tree/release-2.9
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/macat/
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请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

弗雷德哈钦森癌症研究中心