要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“oneChannelGUI”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

oneChannelGUI

这个包适用于Bioconductor 2.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见oneChannelGUI

一个图形界面的设计,以方便分析微阵列和miRNA/RNA-seq数据在笔记本电脑。

Bioconductor版本:2.9

开发这个包是为了简化对编写R代码经验有限或没有经验的初学者使用Bioconductor工具。该库提供了微阵列基因和外显子水平分析以及miRNA/mRNA-seq数据分析的图形界面。

作者:Raffale A Calogero,都灵(意大利)分子生物技术中心生物信息学和基因组学部门

维护者:Raffaele A Calogero < Raffaele。卡洛杰罗在unito, >

引文(从R内,输入引用(“oneChannelGUI”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“oneChannelGUI”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“oneChannelGUI”)

PDF Exon-level.analysis.pdf
PDF fignew42.pdf
PDF gene-level.analysis.pdf
PDF install.pdf
PDF RNAseq.pdf
PDF standAloneFunctions.pdf
PDF whatIsNew.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImportDifferentialExpressionGUIHighThroughputSequencing微阵列MultipleComparisonsOneChannel预处理质量控制RNAseq软件统计数据
版本 1.20.19
在Bioconductor BioC 2.0 (R-2.5)(9年)
许可证 艺术许可,2.0版
取决于 BiobaseaffylmGUItkWidgetsIRangesRsamtoolsBiostrings
进口
链接
建议 注释genefiltermaSigPropamrpdmclassChIPpeakAnnochipseqBSgenomeRgraphvizaffyannaffyaffyPLMssizesizepowersiggenesRankProdorg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dborg.Rn.eg.db刨边机metaArrayMergeMaidbiomaRtGenomeGraphsAffyCompatiblertracklayerGenominatorEDASeqlimmaDESeqgoseqhugene10sttranscriptcluster.dbmogene10sttranscriptcluster.dbragene10sttranscriptcluster.dbGOstatsAnnotationDbipreprocessCorebaySeqHuExExonProbesetLocationMoExExonProbesetLocationRaExExonProbesetLocationRmiRRmiR.Hs.miRNABSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4R.utils
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bioinformatica.unito.it/oneChannelGUI/
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 oneChannelGUI_1.20.19.tar.gz
Windows二进制 oneChannelGUI_1.20.19.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/oneChannelGUI/tree/release-2.9
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/oneChannelGUI/
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弗雷德哈钦森癌症研究中心