要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ compgo”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅compgo。
生物导体版本:3.0
该软件包包含完成多个任务的功能。它能够从UCSC下载完整的基因组数据库,轻松地导入文件,以上述数据库转储的基因(加距离)的基因(加距离)注释这些.bed文件区域,与David接口以创建功能注释和基因本体学富集图表,并根据基因列表列表(例如从输入.bed文件生成的),最后使用有向的无环形图或散点图可视化和比较这些富集。
作者:Sam D. Bassett [Aut],Ashley J. Waardenberg [AUT,CRE]
维护者:Ashley J. Waardenberg
引用(从r内,输入引用(“ compgo”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ compgo”)
compgo-vignette.pdf | ||
R脚本 | 介绍 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 去,,,,基因烯,,,,多重组合,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(2年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | rdavidwebservice |
进口 | rtracklayer,,,,rgraphviz,,,,GGPLOT2,,,,GenomicFeatures,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,pcamethods,,,,RESHAPE2,,,,PathView |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | compgo_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | compgo_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | compgo_1.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | compgo_1.2.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/compgo/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/compgo/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |