要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ compgo”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

compgo

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅compgo

用于.bed文件注释的r管道,比较基因集与数据可视化之间的GO期限富集

生物导体版本:3.0

该软件包包含完成多个任务的功能。它能够从UCSC下载完整的基因组数据库,轻松地导入文件,以上述数据库转储的基因(加距离)的基因(加距离)注释这些.bed文件区域,与David接口以创建功能注释和基因本体学富集图表,并根据基因列表列表(例如从输入.bed文件生成的),最后使用有向的无环形图或散点图可视化和比较这些富集。

作者:Sam D. Bassett [Aut],Ashley J. Waardenberg [AUT,CRE]

维护者:Ashley J. Waardenberg

引用(从r内,输入引用(“ compgo”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ compgo”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ compgo”)

PDF compgo-vignette.pdf
PDF R脚本 介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 ,,,,基因烯,,,,多重组合,,,,软件,,,,可视化
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(2年)
执照 GPL-2
要看 rdavidwebservice
进口 rtracklayer,,,,rgraphviz,,,,GGPLOT2,,,,GenomicFeatures,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,pcamethods,,,,RESHAPE2,,,,PathView
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 compgo_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 compgo_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) compgo_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) compgo_1.2.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/compgo/tree/release-3.0
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/compgo/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户
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