要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ dnaser”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

dnaser

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅dnaser

DNase I的DNase-Seq数据的足迹分析

生物导体版本:3.0

“双重打击” DNase-Seq数据中的链特异性数字基因组足迹。累积的Skellam分布函数(包装“ Skellam”)用于检测每个DNA链处的相对符号的显着归一化计数差异。这样做是为了确定蛋白质结合的足迹侧面。在运行DNASER之前,建议对映射读取进行预处理(例如,质量检查和去除序列特异性偏差)。

作者:pedro madrigal

维护者:pedro madrigal

引用(从r内,输入引用(“ dnaser”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ dnaser”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ DNASER”)

PDF R脚本 DNASER VIGNETTE
PDF 参考手册
文本 执照

细节

生物浏览 遗传学,,,,软件,,,,转录
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年)
执照 GPL-2 +文件许可证
要看 r(> = 2.10.0),生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges
进口 GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,rsamtools
链接
建议 运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 dnaser_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 dnaser_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) dnaser_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) dnaser_1.4.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/dnaser/tree/release-3.0
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/dnaser/
软件包下载报告 下载统计

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生物导体

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户
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