要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MethylMix”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MethylMix.
Bioconductor版本:3.0
MethylMix是一种用于识别疾病的高甲基化和低甲基化基因的算法。MethylMix基于beta混合模型来识别甲基化状态,并将其与正常的DNA甲基化状态进行比较。MethylMix使用了一个新的统计量,差甲基化值或dm值,定义为甲基化状态与正常甲基化状态的差异。最后,匹配的基因表达数据通过关注影响基因表达的甲基化变化来识别除了差异之外的功能甲基化状态。
作者:Olivier Gevaert
维护者:Olivier Gevaert < Olivier。Gevaert在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“MethylMix”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MethylMix”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MethylMix”)
R脚本 | MethylMix | |
参考手册 |
biocViews | DNAMethylation,DifferentialExpression,DifferentialMethylation,GeneExpression,GeneRegulation,MethylationArray,网络,通路,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.1.1) |
进口 | foreach平行,doParallel,RColorBrewer,optimx,RPMM |
链接 | |
建议 | BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | MethylMix_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | MethylMix_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | MethylMix_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | MethylMix_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/MethylMix/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MethylMix/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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