要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MethylMix”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

MethylMix

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MethylMix

MethylMix:鉴定甲基化驱动的癌症基因。

Bioconductor版本:3.0

MethylMix是一种用于识别疾病的高甲基化和低甲基化基因的算法。MethylMix基于beta混合模型来识别甲基化状态,并将其与正常的DNA甲基化状态进行比较。MethylMix使用了一个新的统计量,差甲基化值或dm值,定义为甲基化状态与正常甲基化状态的差异。最后,匹配的基因表达数据通过关注影响基因表达的甲基化变化来识别除了差异之外的功能甲基化状态。

作者:Olivier Gevaert

维护者:Olivier Gevaert < Olivier。Gevaert在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“MethylMix”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MethylMix”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MethylMix”)

PDF R脚本 MethylMix
PDF 参考手册

细节

biocViews DNAMethylationDifferentialExpressionDifferentialMethylationGeneExpressionGeneRegulationMethylationArray网络通路软件StatisticalMethod
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.1.1)
进口 foreach平行,doParallelRColorBreweroptimxRPMM
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 MethylMix_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 MethylMix_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) MethylMix_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) MethylMix_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/MethylMix/tree/release-3.0
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MethylMix/
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