要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pwmenrich”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

pwmenrich

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅pwmenrich

PWM富集分析

生物导体版本:3.0

用于DNA基序扫描和富集分析的高级功能的工具包。主要功能是对已知的PWM的PWM富集分析(例如,来自数据库,例如iTobifDB),但该软件包还实现了用于PWM扫描和可视化的高级功能。该软件包不会执行“从头”主题发现,而是专注于使用实验得出或由其他工具构建的计算的主题。

作者:Robert Stojnic,Diego Diez

维护者:robert stojnic

引用(从r内,输入引用(“ Pwmenrich”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pwmenrich”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Pwmenrich”)

PDF R脚本 “ PWMENRICH”软件包的概述
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 测序,,,,软件
版本 4.2.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(3。5年)
执照 LGPL(> = 2)
要看 方法,网格,生物基因,,,,生物弦
进口 seqlogo,,,,gdata,,,,evd
链接
建议 主题,,,,bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3,,,,pwmenrich.dmelanogaster.background,,,,测试,,,,gtools, 平行,pwmenrich.hsapiens.background,,,,pwmenrich.mmusculus.background
系统要求
增强
URL
取决于我 pwmenrich.dmelanogaster.background,,,,pwmenrich.hsapiens.background,,,,pwmenrich.mmusculus.background
进口我
建议我 rtrm
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 pwmenrich_4.2.0.tar.gz
Windows二进制 pwmenrich_4.2.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) pwmenrich_4.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) pwmenrich_4.2.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/pwmenrich/tree/release-3.0
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pwmenrich/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户
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