要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("RUVSeq")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

RUVSeq

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RUVSeq

从RNA-Seq数据中去除不必要的变异

Bioconductor版本:3.0

这个包实现了Risso等人(2014)的去除不需要的变异(RUV)方法,用于标准化样本之间的RNA-Seq读取计数。

作者:Davide Risso和Sandrine Dudoit

维护者:Davide Risso < Risso。大卫。gmail.com >

引用(从R中,输入引用(“RUVSeq”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("RUVSeq")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“RUVSeq”)

PDF R脚本 RUVSeq:从RNA-Seq数据中去除不必要的变异
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpression预处理RNASeq软件
版本 1.0.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 EDASeq(> = 1.99.1),刨边机
进口 方法,质量
链接
建议 BiocStyleknitrRColorBrewerzebrafishRNASeqDESeq
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 RUVSeq_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 RUVSeq_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) RUVSeq_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) RUVSeq_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/RUVSeq/tree/release-3.0
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/RUVSeq/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

弗雷德·哈钦森癌症研究中心