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SeqArray
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这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SeqArray。
大数据管理的全基因组测序变体
Bioconductor版本:3.0
大数据管理的全基因组变异使用CoreArray c++库:基因型数据和注释存储在一个array-oriented方式,提供高效的访问的遗传变异使用编程语言。
作者:Xiuwen郑(aut (cre),斯蒂芬妮Gogarten (aut),凯茜劳里(施)
维护人员:Xiuwen郑< zhengx u.washington.edu >
从内部引用(R,回车引用(“SeqArray”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“SeqArray”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SeqArray”)
| R脚本 | SeqArray | |
| SeqArray-JSM2013.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 遗传学,基础设施,测序,软件 |
| 版本 | 1.6.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(3年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | gdsfmt> =(1.1.0版) |
| 进口 | 方法,Biostrings,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,VariantAnnotation |
| 链接 | gdsfmt |
| 建议 | 平行,BiocStyle,BiocGenerics,RUnit,Rcpp |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://corearray.sourceforge.net/tutorials/SeqArray/http://github.com/zhengxwen/SeqArray |
| 取决于我 | SeqVarTools |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | SeqArray_1.6.1.tar.gz |
| Windows二进制 | SeqArray_1.6.1.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | SeqArray_1.6.1.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | SeqArray_1.6.1.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/seqarray/tree/release - 3.0 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SeqArray/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
