要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“TEQC”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TEQC.
Bioconductor版本:3.0
目标捕获实验结合了基于杂交的(在溶液中或微阵列上)捕获和富集感兴趣的基因组区域(例如外显子组),并对捕获的DNA片段进行高通量测序。该包提供了用于评估和可视化目标富集过程质量的功能,如捕获的特异性和敏感性,每个目标读取覆盖率等等。
作者:M. Hummel, S. Bonnin, E. Lowy, G. Roma
维修工:Manuela Hummel
引文(从R内,输入引用(“TEQC”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“TEQC”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TEQC”)
R脚本 | TEQC | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 遗传学,微阵列,质量控制,测序,软件 |
版本 | 3.6.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | 方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.13.5),Rsamtools,hwriter |
进口 | Biobase(> = 2.15.1) |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | TEQC_3.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | TEQC_3.6.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | TEQC_3.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | TEQC_3.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/TEQC/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/TEQC/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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