要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“TEQC”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

TEQC

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TEQC

目标捕获实验的质量控制

Bioconductor版本:3.0

目标捕获实验结合了基于杂交的(在溶液中或微阵列上)捕获和富集感兴趣的基因组区域(例如外显子组),并对捕获的DNA片段进行高通量测序。该包提供了用于评估和可视化目标富集过程质量的功能,如捕获的特异性和敏感性,每个目标读取覆盖率等等。

作者:M. Hummel, S. Bonnin, E. Lowy, G. Roma

维修工:Manuela Hummel

引文(从R内,输入引用(“TEQC”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“TEQC”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TEQC”)

PDF R脚本 TEQC
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 遗传学微阵列质量控制测序软件
版本 3.6.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.13.5),Rsamtoolshwriter
进口 Biobase(> = 2.15.1)
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 TEQC_3.6.0.tar.gz
Windows二进制 TEQC_3.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) TEQC_3.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) TEQC_3.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/TEQC/tree/release-3.0
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/TEQC/
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Bioconductor

R/凹口包和文档

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请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

弗雷德哈钦森癌症研究中心