要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“affxparser”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

affxparser

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affxparser

Affymetrix文件解析SDK

Bioconductor版本:3.0

用于解析Affymetrix文件的包(CDF, CEL, CHP, BPMAP, BAR)。它使用Affymetrix的Fusion SDK提供了快速和内存高效解析Affymetrix文件的方法。支持基于ASCII和二进制的文件。目前,有读取芯片定义文件(CDF)和单元强度文件(CEL)的方法。这些文件可以全部读取,也可以部分读取。例如,可以非常快速地从一组CEL文件中提取来自几个探测集的探测信号到一个方便的列表结构中。

作者:Henrik Bengtsson [aut], James Bullard [aut], Robert Gentleman [ctb], Kasper Daniel Hansen [aut, cre], Martin Morgan [ctb]

维护者:Kasper Daniel Hansen

引文(从R内,输入引用(“affxparser”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“affxparser”)

文档

PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport基础设施软件
版本 1.38.0
在Bioconductor BioC 1.7 (R-2.2)(10.5年)
许可证 LGPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.6.0)
进口
链接
建议 R.oo(> = 1.18.0),R.utils(> = 1.32.4),AffymetrixDataTestFiles
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/HenrikBengtsson/affxparser/
全靠我 斜体pdInfoBuilderrMAT斯塔尔
进口我 affyILMAffyTilingcn.farmsGeneRegionScan斜体益生元rMAT
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 affxparser_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 affxparser_1.38.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) affxparser_1.38.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) affxparser_1.38.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/affxparser/tree/release-3.0
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/affxparser/
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