要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“affxparser”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affxparser。
Bioconductor版本:3.0
用于解析Affymetrix文件的包(CDF, CEL, CHP, BPMAP, BAR)。它使用Affymetrix的Fusion SDK提供了快速和内存高效解析Affymetrix文件的方法。支持基于ASCII和二进制的文件。目前,有读取芯片定义文件(CDF)和单元强度文件(CEL)的方法。这些文件可以全部读取,也可以部分读取。例如,可以非常快速地从一组CEL文件中提取来自几个探测集的探测信号到一个方便的列表结构中。
作者:Henrik Bengtsson [aut], James Bullard [aut], Robert Gentleman [ctb], Kasper Daniel Hansen [aut, cre], Martin Morgan [ctb]
维护者:Kasper Daniel Hansen
引文(从R内,输入引用(“affxparser”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“affxparser”)
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,基础设施,软件 |
版本 | 1.38.0 |
在Bioconductor | BioC 1.7 (R-2.2)(10.5年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.6.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | R.oo(> = 1.18.0),R.utils(> = 1.32.4),AffymetrixDataTestFiles |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/HenrikBengtsson/affxparser/ |
全靠我 | 斜体,pdInfoBuilder,rMAT,斯塔尔 |
进口我 | affyILM,AffyTiling,cn.farms,GeneRegionScan,斜体,益生元,rMAT |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | affxparser_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | affxparser_1.38.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | affxparser_1.38.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | affxparser_1.38.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/affxparser/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/affxparser/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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