要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("biomvRCNS")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

biomvRCNS

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见biomvRCNS

多变量生物数据的拷贝数研究与分割

Bioconductor版本:3.0

在这个包中,设计并实现了一个隐藏半马尔可夫模型(HSMM)和一个同质分割模型,用于分割基因组数据,目的是帮助使用RNA-seq或平片阵列等高通量技术进行转录本检测,并使用aCGH或测序进行拷贝数分析。

作者:杨杜

维护者:杨度<杨。杜在uni-rostock.de >

引用(从R中,输入引用(“biomvRCNS”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("biomvRCNS")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“biomvRCNS”)

PDF R脚本 biomvRCNS方案介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariation遗传学微阵列测序软件可视化aCGH
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 IRangesGenomicRangesGviz
进口 方法,mvtnorm
链接
建议 集群平行,GenomicFeaturesdynamicTreeCutRsamtoolsTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 biomvRCNS_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 biomvRCNS_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) biomvRCNS_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) biomvRCNS_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/biomvRCNS/tree/release-3.0
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/biomvRCNS/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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弗雷德·哈钦森癌症研究中心