##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("clipper")

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本，请参见限幅器．

利用路径拓扑的基因集分析

Bioconductor版本:3.0

Clipper是一个用于拓扑基因集分析的软件包。它实现了一种两步经验方法，基于利用图分解到连接树重构最相关的信号路径。在第一步中，裁剪器根据从路径拓扑中得到的图的均值和浓度矩阵的统计检验选择显著路径。然后，它“剪辑”整个通路，识别与特定表现型有最大关联的信号通路。

作者:保罗·马提尼<保罗。在gmail.com cavei >，Gabriele Sales , Chiara Romualdi

维护者:保罗·马提尼<保罗。在gmail.com cavei >

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("clipper")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“快船”)

PDF	R脚本	限幅器
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件
版本	1.6.2
Bioconductor自	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	AGPL-3
取决于	R (> = 2.15.0),矩阵，图
进口	方法,Biobase，Rcpp，igraph，gRbase(> = 1.6.6),qpgraph，KEGGgraph，corpcor，RBGL
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，RCytoscape(> = 1.6.3),石墨，所有，hgu95av2.db，质量，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	ToPASeq
建议我	石墨
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	clipper_1.6.2.tar.gz
Windows二进制	clipper_1.6.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	clipper_1.6.2.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队)	clipper_1.6.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/clipper/tree/release-3.0
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/clipper/
包下载报告	下载数据