要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ custicprodb”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅CustomProdb。
生物导体版本:3.0
从RNA-seq数据中生成定制的蛋白质序列数据库,以进行蛋白质组学搜索
作者:王王
维护者:vanderbilt.edu> xiaojing wang
引用(从r内,输入引用(“ CustomProdB”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ custicprodb”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ customprodb”)
R脚本 | CustomProdb简介 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 蛋白质组学,,,,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.0.1),iranges,,,,AnnotationDbi,,,,Biomart |
进口 | iranges,,,,基因组机,,,,rsamtools(> = 1.10.2),基因组签名,,,,生物弦(> = 2.26.3),GenomicFeatures(> = 1.17.13),Biomart(> = 2.17.1),Stringr,,,,rcurl,,,,plyr,,,,变体(> = 1.7.28),rtracklayer,,,,rsqlite,,,,AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | customProdb_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | customProdb_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | customProdb_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | customProdb_1.6.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/customprodb/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/customprodb/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |