要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ custicprodb”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

CustomProdb

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅CustomProdb

从NGS数据中生成定制的蛋白质数据库,重点是RNA-Seq数据,用于蛋白质组学搜索。

生物导体版本:3.0

从RNA-seq数据中生成定制的蛋白质序列数据库,以进行蛋白质组学搜索

作者:王王

维护者:vanderbilt.edu> xiaojing wang

引用(从r内,输入引用(“ CustomProdB”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ custicprodb”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ customprodb”)

PDF R脚本 CustomProdb简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 蛋白质组学,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.0.1),iranges,,,,AnnotationDbi,,,,Biomart
进口 iranges,,,,基因组机,,,,rsamtools(> = 1.10.2),基因组签名,,,,生物弦(> = 2.26.3),GenomicFeatures(> = 1.17.13),Biomart(> = 2.17.1),Stringr,,,,rcurl,,,,plyr,,,,变体(> = 1.7.28),rtracklayer,,,,rsqlite,,,,AnnotationDbi
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 customProdb_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 customProdb_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) customProdb_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) customProdb_1.6.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/customprodb/tree/release-3.0
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/customprodb/
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