要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“h5vc”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见h5vc.
Bioconductor版本:3.0
这个包包含与存储在HDF5文件中的NGS实验数据交互的函数。详情请参见http://www.ebi.ac.uk/~pyl/h5vc的网页。
作者:Paul Theodor Pyl
维护者:Paul Theodor Pyl < Pyl at embl.de>
引文(从R内,输入引用(“h5vc”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“h5vc”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“h5vc”)
超文本标记语言 | R脚本 | 用h5vc和shiny构建最小基因组浏览器 |
超文本标记语言 | R脚本 | h5vc—旅游 |
参考手册 |
biocViews | 软件 |
版本 | 2.0.6 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL (>= 3) |
取决于 | 网格,gridExtra,ggplot2 |
进口 | rhdf5,重塑,S4Vectors,IRanges,Biostrings,Rsamtools、方法、GenomicRanges,abind,BiocParallel,BatchJobs,h5vcData,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | knitr,locfit,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,bit64,biomaRt,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | h5vcData |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | h5vc_2.0.6.tar.gz |
Windows二进制 | h5vc_2.0.6.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | h5vc_2.0.6.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | h5vc_2.0.6.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/h5vc/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/h5vc/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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