要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("missMethyl")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见missMethyl.
Bioconductor版本:3.0
Illumina公司Infinium HumanMethylation450阵列数据的归一化和差异可变性测试。归一化过程是数组内子集分位数归一化(SWAN),它允许在单个数组上同时归一化Infinium I和II型探针。差异可变性的检验是基于Levene检验的经验贝叶斯版本。
作者:Belinda Phipson和Jovana Maksimovic
维护者:Belinda Phipson < Belinda。phpson在mcri.edu.au>, Jovana Maksimovic < Jovana。在mcri.edu.au maksimovic >
引用(从R中,输入引用(“missMethyl”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("missMethyl")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“missMethyl”)
R脚本 | missMethyl:分析来自Illumina公司HumanMethylation450阵列的数据 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DNAMethylation,DifferentialMethylation,GeneticVariability,GenomicVariation,MethylationArray,归一化,软件 |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = tripwire) |
进口 | limma,minfi,methylumi,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,statmod |
链接 | |
建议 | minfiData,BiocStyle,刨边机,tweeDEseqCountData |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | missMethyl_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | missMethyl_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | missMethyl_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | missMethyl_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/missMethyl/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/missMethyl/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: