要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("missMethyl")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

missMethyl

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见missMethyl

甲基化阵列数据分析

Bioconductor版本:3.0

Illumina公司Infinium HumanMethylation450阵列数据的归一化和差异可变性测试。归一化过程是数组内子集分位数归一化(SWAN),它允许在单个数组上同时归一化Infinium I和II型探针。差异可变性的检验是基于Levene检验的经验贝叶斯版本。

作者:Belinda Phipson和Jovana Maksimovic

维护者:Belinda Phipson < Belinda。phpson在mcri.edu.au>, Jovana Maksimovic < Jovana。在mcri.edu.au maksimovic >

引用(从R中,输入引用(“missMethyl”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("missMethyl")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“missMethyl”)

PDF R脚本 missMethyl:分析来自Illumina公司HumanMethylation450阵列的数据
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylationDifferentialMethylationGeneticVariabilityGenomicVariationMethylationArray归一化软件
版本 1.0.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = tripwire)
进口 limmaminfimethylumiIlluminaHumanMethylation450kmanifeststatmod
链接
建议 minfiDataBiocStyle刨边机tweeDEseqCountData
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 missMethyl_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 missMethyl_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) missMethyl_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) missMethyl_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/missMethyl/tree/release-3.0
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/missMethyl/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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弗雷德·哈钦森癌症研究中心