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这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qusage。

qusage:定量分析基因的表达

Bioconductor版本:3.0

这个包是一组实现定量分析基因表达(QuSAGE)方法中描述(Yaari g . et al诊断酸Res, 2013)。这是一种新型的基因集浓缩型测试,其目的是提供一个更快,更准确,更容易理解测试基因表达研究。qusage占inter-gene相关性使用方差膨胀因子技术提出的吴et al。(核酸Res, 2012)。此外,而不是简单地评估偏离零假设和一个数字(P值),qusage量化基因集活动与一个完整的概率密度函数(PDF)。从这个PDF, P值和置信区间可以很容易地提取出来。保存PDF还允许因果分析(例如,成对比较基因集活动),同时保持统计可追溯性。最后,虽然qusage兼容个人基因数据从现有的方法(例如,LIMMA) Welch-based方法实现显示提高特异性。问题,接触(cbolen1@gmail.com)或克里斯·保伦史蒂文Kleinstein (steven.kleinstein@yale.edu)

作者:克里斯托弗·保伦和Gur Yaari,来自Juilee Thakar和史蒂文Kleinstein

在gmail.com <维护者:克里斯托弗·保伦cbolen1 >

安装

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文档

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PDF	R脚本	运行qusage
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneSetEnrichment,微阵列,RNASeq,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10),limma(> = 3.14),方法
进口	跑龙套,Biobase
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://clip.med.yale.edu/qusage
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	qusage_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	qusage_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	qusage_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	qusage_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/qusage/tree/release - 3.0
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/qusage/
包下载报告	下载数据