要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“allelic失衡”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见AllelicImbalance.
Bioconductor版本:3.1
为使用RNA-seq数据进行等位基因特异性表达研究提供了一个框架。
作者:Jesper R Gadin, Lasse Folkersen
维护者:Jesper R Gadin
引文(从R内,输入引用(“AllelicImbalance”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“allelic失衡”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“AllelicImbalance”)
AllelicImbalance-vignette.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 遗传学,基础设施,测序,软件 |
版本 | 1.6.2 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(>= 3.1.0),网格,GenomicRanges,GenomicAlignments,VariantAnnotation,Gviz |
进口 | 方法,BiocGenerics,AnnotationDbi,Biostrings,S4Vectors,IRanges,Rsamtools,GenomicFeatures,Gviz,晶格,seqinr,GenomeInfoDb,VariantAnnotation |
链接 | |
建议 | testthat,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/pappewaio/AllelicImbalance |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | AllelicImbalance_1.6.2.tar.gz |
Windows二进制 | AllelicImbalance_1.6.2.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | AllelicImbalance_1.6.2.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | AllelicImbalance_1.6.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/AllelicImbalance/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/AllelicImbalance/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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