要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“allelic失衡”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

AllelicImbalance

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见AllelicImbalance

研究等位基因的特异性表达

Bioconductor版本:3.1

为使用RNA-seq数据进行等位基因特异性表达研究提供了一个框架。

作者:Jesper R Gadin, Lasse Folkersen

维护者:Jesper R Gadin

引文(从R内,输入引用(“AllelicImbalance”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“allelic失衡”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“AllelicImbalance”)

PDF AllelicImbalance-vignette.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 遗传学基础设施测序软件
版本 1.6.2
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 3.1.0),网格,GenomicRangesGenomicAlignmentsVariantAnnotationGviz
进口 方法,BiocGenericsAnnotationDbiBiostringsS4VectorsIRangesRsamtoolsGenomicFeaturesGviz晶格seqinrGenomeInfoDbVariantAnnotation
链接
建议 testthatorg.Hs.eg.dbTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneSNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608knitr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/pappewaio/AllelicImbalance
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 AllelicImbalance_1.6.2.tar.gz
Windows二进制 AllelicImbalance_1.6.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) AllelicImbalance_1.6.2.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) AllelicImbalance_1.6.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/AllelicImbalance/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/AllelicImbalance/
软件包下载报告 下载数据

文档»

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支持»

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