要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“CNVrd2”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见CNVrd2.
Bioconductor版本:3.1
CNVrd2利用下一代测序数据测量多个样本的人类基因拷贝数,识别标记拷贝数变体的snp,并检测拷贝数多态性基因组区域。
作者:黄檀阮,托尼R梅里曼和米克布莱克
维护:Hoang Tan Nguyen
引文(从R内,输入引用(“CNVrd2”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“CNVrd2”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“CNVrd2”)
R脚本 | Markdown Vignette与针织 | |
参考手册 |
biocViews | 集群。,CopyNumberVariation,报道,LinkageDisequilibrium,单核苷酸多态性,测序,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R(>= 3.0.0),方法,VariantAnnotation平行,rjags,ggplot2,gridExtra |
进口 | DNAcopy,IRanges,Rsamtools |
链接 | |
建议 | knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/hoangtn/CNVrd2 |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | CNVrd2_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | CNVrd2_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | CNVrd2_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | CNVrd2_1.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/CNVrd2/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/CNVrd2/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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