##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“DEGraph”)

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见DEGraph。

图上的两样本测试

Bioconductor版本:3.1

DEGraph实现了最近的假设检验方法，直接评估一个特定的基因网络是否在两个条件之间表达差异。这将与更经典的两步方法形成对比，这些方法首先测试单个基因，然后测试基因集在差异表达基因中的富集情况。这些最新的方法考虑到网络的拓扑结构，从而产生更强大的检测程序。DEGraph提供了在任何基因表达数据集上轻松测试差异表达的所有KEGG通路的方法和可视化结果的工具。

作者:劳伦特·雅各布，皮埃尔·纽维尔和桑德琳·杜杜伊特

维护者:Laurent Jacob < Laurent。雅各布在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“DEGraph”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DEGraph”)

PDF	R脚本	DEGraph:基因网络的差异表达测试
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DecisionTree，DifferentialExpression，GraphAndNetwork，微阵列，网络，NetworkEnrichment，软件
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10.0)，R.utils
进口	图，KEGGgraph，晶格，mvtnorm，R.methodsS3，RBGL，Rgraphviz，rrcov，NCIgraph
链接
建议	corpcor，字段，图，KEGGgraph，晶格，marray，RBGL，rrcov，Rgraphviz，NCIgraph
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	石墨，ToPASeq
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	DEGraph_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	DEGraph_1.20.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	DEGraph_1.20.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	DEGraph_1.20.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/DEGraph/tree/release-3.1
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DEGraph/
软件包下载报告	下载数据