要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ dmrcaller”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

DMRCALLER

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅DMRCALLER

差异甲基化区域

生物导体版本:3.1

在两个条件下使用硫甘硫酸盐测序数据,并确定CG和非CG环境中条件之间的差异甲基化区域。输入是Bismark生成的CX报告文件,输出是存储为Granges对象的DMR列表。

作者:nicolae radu Zabet 和Jonathan Michael Foonlan Tsang

维护者:nicolae radu zabet

引用(从r内,输入引用(“ dmrcaller”)):

安装

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ dmrcaller”)

PDF R脚本 DMRCALLER
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,DNAMETHYLATY,,,,差甲基化,,,,测序,,,,软件
版本 1.0.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(1年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.2),基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS
进口 平行,RCPP,,,,rcpproll
链接
建议 尼特,,,,运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 dmrcaller_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制 DMRCALLER_1.0.0.ZIP
Mac OS X 10.6(雪豹) DMRCALLER_1.0.0.TGZ
Mac OS X 10.9(Mavericks) DMRCALLER_1.0.0.TGZ
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/dmrcaller/tree/release-3.1
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/dmrcaller/
软件包下载报告 下载统计

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