要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("DNAcopy")

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

DNAcopy

该软件包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DNAcopy

DNA拷贝数数据分析

Bioconductor版本:3.1

采用循环二值分割(CBS)算法对DNA拷贝数数据进行分割,识别拷贝数异常的基因组区域。

作者:Venkatraman E. Seshan, Adam Olshen

维护者:Venkatraman E. Seshan

引用(来自R,输入引用(“DNAcopy”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("DNAcopy")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“DNAcopy”)

PDF R脚本 DNAcopy
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariation微阵列软件
版本 1.42.0
在Bioconductor中 BioC 1.6 (R-2.1)或更早(bbb11年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我 CGHcallcghMCR单克隆CopyNumber450kCRImagesnapCGHSomatiCA
进口我 ADaCGH2ArrayTV冠军单克隆cn.farmsCNAnormCNVrd2conumee文案GWASToolsMEDIPSMinimumDistanceQDNAseqRepitoolssnapCGHSomatiCA
建议我 beadarraySNP单克隆cn.mopsfastseggenoset
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源 DNAcopy_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 DNAcopy_1.42.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) DNAcopy_1.42.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) DNAcopy_1.42.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/DNAcopy/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/DNAcopy/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

R/凹口包和文档

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请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

Fred Hutchinson癌症研究中心