要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("DNAcopy")
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
该软件包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DNAcopy.
Bioconductor版本:3.1
采用循环二值分割(CBS)算法对DNA拷贝数数据进行分割,识别拷贝数异常的基因组区域。
作者:Venkatraman E. Seshan, Adam Olshen
维护者:Venkatraman E. Seshan
引用(来自R,输入引用(“DNAcopy”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("DNAcopy")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“DNAcopy”)
R脚本 | DNAcopy | |
参考手册 |
biocViews | CopyNumberVariation,微阵列,软件 |
版本 | 1.42.0 |
在Bioconductor中 | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(bbb11年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | CGHcall,cghMCR,单克隆,CopyNumber450k,CRImage,snapCGH,SomatiCA |
进口我 | ADaCGH2,ArrayTV,冠军,单克隆,cn.farms,CNAnorm,CNVrd2,conumee,文案,GWASTools,MEDIPS,MinimumDistance,QDNAseq,Repitools,snapCGH,SomatiCA |
建议我 | beadarraySNP,单克隆,cn.mops,fastseg,genoset |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | DNAcopy_1.42.0.tar.gz |
Windows二进制 | DNAcopy_1.42.0.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | DNAcopy_1.42.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | DNAcopy_1.42.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/DNAcopy/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DNAcopy/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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