要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“富集浏览器”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

EnrichmentBrowser

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见EnrichmentBrowser

基于集的和基于网络的丰富分析相结合的无缝导航

Bioconductor版本:3.1

richmentbrowser包实现了基因表达数据的丰富分析的基本功能。该分析结合了基于集的富集分析和基于网络的富集分析的优势,以获得在所研究的表达数据中差异调控的高置信基因集和生物途径。此外,该软件包促进了这些集和路径的可视化和探索。

作者:Ludwig Geistlinger

维护者:Ludwig Geistlinger

引文(从R内,输入引用(“EnrichmentBrowser”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“富集浏览器”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“EnrichmentBrowser”)

PDF R脚本 EnrichmentBrowser手册
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionGeneSetEnrichmentGraphAndNetwork微阵列网络NetworkEnrichment通路RNASeqReportWriting软件可视化
版本 1.2.2
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.0.0),BiobaseGSEABasepathview
进口 AnnotationDbiComplexHeatmapDESeq2EDASeqGenomicRangesGO.dbKEGGRESTKEGGgraph质量PathNetReportingToolsRgraphvizS4VectorsSparseMSPIAbiocGraphbiomaRt刨边机geneplotterhwriterlimmamixtoolsneaGUInpGSEA安全stringrtopGO
链接
建议 所有BiocStyle气道hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 EnrichmentBrowser_1.2.2.tar.gz
Windows二进制 EnrichmentBrowser_1.2.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) EnrichmentBrowser_1.2.2.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) EnrichmentBrowser_1.2.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/EnrichmentBrowser/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/EnrichmentBrowser/
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