要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("FEM")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见有限元法.
Bioconductor版本:3.1
FEM包对DNA甲基化和基因表达数据进行系统级的综合分析。它寻找功能相关的基因模块,显示差异启动子DNA甲基化和差异表达,其中启动子DNA甲基化和基因表达之间的负相关假设。详情请参见Jiao et al Bioinformatics 2014。
作者:Andrew E. Teschendorff,焦寅明
维护者:Andrew E. Teschendorff < Andrew at picb.ac.cn>
引用(从R中,输入引用(“有限元”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("FEM")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“有限元”)
R脚本 | 该FEM包对DNA甲基化和基因表达进行系统级的综合分析。它寻找功能相关的基因模块,显示差异启动子DNA甲基化和差异表达,其中启动子DNA甲基化和基因表达之间的负相关假设。详情请参见Jiao et al Bioinformatics 2014。 | |
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,DifferentialMethylation,NetworkEnrichment,软件,SystemsBiology |
版本 | 2.2.1 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | AnnotationDbi,矩阵,marray,corrplot,igraph,嫁祸于,limma,org.Hs.eg.db |
进口 | 图 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | FEM_2.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | FEM_2.2.1.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | FEM_2.2.1.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | FEM_2.2.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/FEM/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/FEM/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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