要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("FEM")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

有限元法

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见有限元法

功能表观遗传模块的鉴定

Bioconductor版本:3.1

FEM包对DNA甲基化和基因表达数据进行系统级的综合分析。它寻找功能相关的基因模块,显示差异启动子DNA甲基化和差异表达,其中启动子DNA甲基化和基因表达之间的负相关假设。详情请参见Jiao et al Bioinformatics 2014。

作者:Andrew E. Teschendorff,焦寅明

维护者:Andrew E. Teschendorff < Andrew at picb.ac.cn>

引用(从R中,输入引用(“有限元”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("FEM")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“有限元”)

PDF R脚本 该FEM包对DNA甲基化和基因表达进行系统级的综合分析。它寻找功能相关的基因模块,显示差异启动子DNA甲基化和差异表达,其中启动子DNA甲基化和基因表达之间的负相关假设。详情请参见Jiao et al Bioinformatics 2014。
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpressionDifferentialMethylationNetworkEnrichment软件SystemsBiology
版本 2.2.1
Bioconductor自 BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 AnnotationDbi矩阵marraycorrplotigraph嫁祸于limmaorg.Hs.eg.db
进口
链接
建议
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增强了
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取决于我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 FEM_2.2.1.tar.gz
Windows二进制 FEM_2.2.1.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) FEM_2.2.1.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) FEM_2.2.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/FEM/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/FEM/
包下载报告 下载数据

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请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

弗雷德·哈钦森癌症研究中心