要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GSEABase")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GSEABase.
Bioconductor版本:3.1
这个包提供了支持基因集富集分析(GSEA)的类和方法。
作者:马丁·摩根,赛斯·法尔肯,罗伯特·绅士
维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者
引用(从R中,输入引用(“GSEABase”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GSEABase")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“GSEABase”)
R脚本 | GSEABase的介绍 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 去,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,KEGG,软件 |
版本 | 1.30.2 |
Bioconductor自 | BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.6.0),BiocGenerics(> = 0.13.8),Biobase(> = 2.17.8),注释(> = 1.45.3)、方法图(> = 1.37.2) |
进口 | AnnotationDbi,XML |
链接 | |
建议 | hgu95av2.db,GO.db,org.Hs.eg.db,Rgraphviz,ReportingTools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | AGDEX,BicARE,cpvSNP,EnrichmentBrowser,gCMAP,GSVAdata,npGSEA,承诺 |
进口我 | 癌症,类别,categoryCompare,cellHTS2,gCMAPWeb,GSRI,GSVA,HTSanalyzeR,mogsa,PCpheno,phenoTest,承诺,ReportingTools |
建议我 | BiocCaseStudies,计,GlobalAncova,globaltest,GOstats,GSAR,GSEAlm,PGSEA,phenoTest |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | GSEABase_1.30.2.tar.gz |
Windows二进制 | GSEABase_1.30.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | GSEABase_1.30.2.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | GSEABase_1.30.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GSEABase/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GSEABase/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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