要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GSEABase")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GSEABase

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GSEABase

基因集富集数据结构与方法

Bioconductor版本:3.1

这个包提供了支持基因集富集分析(GSEA)的类和方法。

作者:马丁·摩根,赛斯·法尔肯,罗伯特·绅士

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

引用(从R中,输入引用(“GSEABase”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GSEABase")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“GSEABase”)

PDF R脚本 GSEABase的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,KEGG,软件
版本 1.30.2
Bioconductor自 BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.6.0),BiocGenerics(> = 0.13.8),Biobase(> = 2.17.8),注释(> = 1.45.3)、方法(> = 1.37.2)
进口 AnnotationDbi,XML
链接
建议 hgu95av2.db,GO.db,org.Hs.eg.db,Rgraphviz,ReportingTools
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 AGDEX,BicARE,cpvSNP,EnrichmentBrowser,gCMAP,GSVAdata,npGSEA,承诺
进口我 癌症,类别,categoryCompare,cellHTS2,gCMAPWeb,GSRI,GSVA,HTSanalyzeR,mogsa,PCpheno,phenoTest,承诺,ReportingTools
建议我 BiocCaseStudies,,GlobalAncova,globaltest,GOstats,GSAR,GSEAlm,PGSEA,phenoTest
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 GSEABase_1.30.2.tar.gz
Windows二进制 GSEABase_1.30.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) GSEABase_1.30.2.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) GSEABase_1.30.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GSEABase/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GSEABase/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

弗雷德·哈钦森癌症研究中心