要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GWASTools")
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
该软件包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GWASTools。
Bioconductor版本:3.1
用于存储非常大的GWAS数据集和注释的类,以及用于GWAS数据清理和分析的函数。
作者:Stephanie M. Gogarten, Cathy Laurie, Tushar Bhangale, Matthew P. Conomos, Cecelia Laurie, Caitlin McHugh, Ian Painter,郑秀文,Jess Shen, Rohit Swarnkar, Adrienne Stilp, Sarah Nelson
维护人员:Stephanie M. Gogarten
引用(来自R,输入引用(“GWASTools”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GWASTools")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“GWASTools”)
R脚本 | gwastool中的数据格式 | |
R脚本 | GWAS数据清理 | |
R脚本 | 准备Affymetrix数据 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneticVariability,微阵列,质量控制,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 1.14.2 |
在Bioconductor中 | BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biobase |
进口 | 方法、ncdfgdsfmt,DBI,RSQLite,GWASExactHW,DNAcopy,生存,三明治,航空航天,logistf,quantsmooth |
链接 | |
建议 | GWASdata,BiocGenerics,RUnit,SNPRelate,snpStats,VariantAnnotation |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | 《创世纪》,GWASdata |
进口我 | |
建议我 | podkat |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | GWASTools_1.14.2.tar.gz |
Windows二进制 | GWASTools_1.14.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | GWASTools_1.14.2.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | GWASTools_1.14.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GWASTools/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GWASTools/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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