要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GWASTools")

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

GWASTools

该软件包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GWASTools

全基因组关联研究工具

Bioconductor版本:3.1

用于存储非常大的GWAS数据集和注释的类,以及用于GWAS数据清理和分析的函数。

作者:Stephanie M. Gogarten, Cathy Laurie, Tushar Bhangale, Matthew P. Conomos, Cecelia Laurie, Caitlin McHugh, Ian Painter,郑秀文,Jess Shen, Rohit Swarnkar, Adrienne Stilp, Sarah Nelson

维护人员:Stephanie M. Gogarten , Adrienne Stilp

引用(来自R,输入引用(“GWASTools”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GWASTools")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“GWASTools”)

PDF R脚本 gwastool中的数据格式
PDF R脚本 GWAS数据清理
PDF R脚本 准备Affymetrix数据
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneticVariability微阵列质量控制单核苷酸多态性软件
版本 1.14.2
在Bioconductor中 BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Biobase
进口 方法、ncdfgdsfmtDBIRSQLiteGWASExactHWDNAcopy生存三明治航空航天logistfquantsmooth
链接
建议 GWASdataBiocGenericsRUnitSNPRelatesnpStatsVariantAnnotation
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我 《创世纪》GWASdata
进口我
建议我 podkat
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源 GWASTools_1.14.2.tar.gz
Windows二进制 GWASTools_1.14.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) GWASTools_1.14.2.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) GWASTools_1.14.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GWASTools/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GWASTools/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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Fred Hutchinson癌症研究中心