要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“LowMACA”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见LowMACA.
Bioconductor版本:3.1
LowMACA包是一套简单的工具,通过一致性对齐来调查和分析几种蛋白质或pfam结构域的突变谱。您可以使用我们的软件包进行假设驱动的探索性分析,只需提供一组您感兴趣的基因或pfam域。
作者:Stefano de Pretis, Giorgio Melloni
维护者:Stefano de Pretis
引文(从R内,输入引用(“LowMACA”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“LowMACA”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“LowMACA”)
R脚本 | LowMACA | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 |
biocViews | 对齐,DataImport,MultipleSequenceAlignment,SequenceMatching,测序,软件,SomaticMutation,WholeGenome |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.10),Biostrings,motifStack |
进口 | cgdsr平行,stringr,reshape2,data.table,RColorBrewer、方法、LowMACAAnnotation |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | Clustalo, gs, perl |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | LowMACA_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | LowMACA_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | LowMACA_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | LowMACA_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/LowMACA/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/LowMACA/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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