要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“LowMACA”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

LowMACA

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见LowMACA

LowMACA -通过一致性比对的低频突变分析

Bioconductor版本:3.1

LowMACA包是一套简单的工具,通过一致性对齐来调查和分析几种蛋白质或pfam结构域的突变谱。您可以使用我们的软件包进行假设驱动的探索性分析,只需提供一组您感兴趣的基因或pfam域。

作者:Stefano de Pretis, Giorgio Melloni

维护者:Stefano de Pretis , Giorgio Melloni < Melloni。乔治在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“LowMACA”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“LowMACA”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“LowMACA”)

PDF R脚本 LowMACA
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻

细节

biocViews 对齐DataImportMultipleSequenceAlignmentSequenceMatching测序软件SomaticMutationWholeGenome
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.10),BiostringsmotifStack
进口 cgdsr平行,stringrreshape2data.tableRColorBrewer、方法、LowMACAAnnotation
链接
建议 knitrrmarkdown
SystemRequirements Clustalo, gs, perl
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 LowMACA_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 LowMACA_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) LowMACA_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) LowMACA_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/LowMACA/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/LowMACA/
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