要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MSnbase”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见MSnbase.
Bioconductor版本:3.1
基于ms的蛋白质组学数据的基本绘制、数据操作和处理。
作者:Laurent Gatto 维护者:Laurent Gatto 引文(从R内,输入 要安装这个包,启动R并输入: 要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入: 遵循2021年欧洲杯比分预测
在R会话中使用此包的说明。引用(“MSnbase”)
):安装
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MSnbase”)
文档
browseVignettes(“MSnbase”)
PDF
R脚本
基于ms的蛋白质组学的基本函数和类
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R脚本
MSnbase发展
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R脚本
MSnbase IO能力
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参考手册
文本
新闻
细节
biocViews
DataImport,基础设施,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件
版本
1.16.2
在Bioconductor
BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证
艺术- 2.0
取决于
R(>= 3.1),方法,BiocGenerics(> =是0.7.1),Biobase(> = 2.15.2),mzR,BiocParallel,ProtGenerics
进口
plyr,IRanges,preprocessCore,vsn、网格reshape2stats4,affy,嫁祸于,pcaMethods,mzID(> = 1.5.2),MALDIquant(> = 1.12.0),消化,晶格,ggplot2,S4Vectors,Rcpp
链接
Rcpp
建议
testthat,动物园,knitr(> = 1.1.0版),的方式,Rdisop,pRoloc,pRolocdata(> = 1.0.7),msdata,roxygen2,rgl,BiocStyle,imputeLCMD,规范,gplots
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports
https://github.com/lgatto/MSnbase/issues
全靠我
msmsEDA,msmsTests,MSstats,ProCoNA,pRoloc,pRolocdata,pRolocGUI,proteoQC,RforProteomics,synapter
进口我
MSnID,Pbase
建议我
BiocGenerics,等压线,qcmetrics,rpx
构建报告
包档案
包的来源
MSnbase_1.16.2.tar.gz
Windows二进制
MSnbase_1.16.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
MSnbase_1.16.2.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
MSnbase_1.16.2.tgz
Subversion源
(用户名/密码:只读的)
Git源代码
https://github.com/Bioconductor-mirror/MSnbase/tree/release-3.1
包短Url
//www.andersvercelli.com/packages/MSnbase/
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