要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“OSAT”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

OSAT

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见OSAT

OSAT:最佳样本分配工具

Bioconductor版本:3.1

一个相当大的基因组学研究,如微阵列,由于实际的复杂性,经常涉及多批(组)实验的使用。为了最大限度地减少批次效应,仔细的实验设计应确保在批次中生物组和混杂因素的均匀分布。开发了OSAT(最佳样品分配工具),以方便将收集的样品分配到不同批次。通过最少的步骤,它产生的设置优化了生物感兴趣的组中的样品均匀分布到不同的批次,减少了批次和感兴趣的生物变量之间的混淆或相关性。它还可以优化混合因素在批次间的均匀分布。我们的工具可以处理不完整和不平衡的样本收集以及理想平衡的RCBD的挑战性实例。OSAT为一些最常用的基因组平台提供了许多预定义的布局。相关论文可在http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/689上找到。

作者:李燕

维护者:李艳<李。roswellpark.org>

引文(从R内,输入引用(“OSAT”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“OSAT”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“OSAT”)

PDF R脚本 关于OSAT的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentationExperimentalDesign质量控制软件可视化
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,统计数据
进口
链接
建议 xtableBiobase
SystemRequirements
增强了
URL http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/689
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 OSAT_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 OSAT_1.16.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) OSAT_1.16.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) OSAT_1.16.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/OSAT/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/OSAT/
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文档»

Bioconductor

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支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

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