要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("PAA")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PAA.
Bioconductor版本:3.1
PAA导入以gpr文件格式保存的单色(蛋白质)微阵列数据,特别是ProtoArray数据。在进行预处理(背景校正、批量过滤、归一化)后,进行单变量特征预选择(例如,使用“最小M统计量”方法——以下简称“mm”)。随后,进行多变量特征选择,以发现生物标志物候选。因此,既可以采用基于频率的反向消除方法,也可以采用集成特征选择。PAA提供了一个完整的分析工具工具箱,包括用于结果检查和评估的几个不同的图。
作者:Michael Turewicz [aut, cre], Martin Eisenacher [ctb, cre]
维护者:Michael Turewicz < Michael。turewicz at rub.de>, Martin Eisenacher < Martin。在rub.de eisenach >
引用(从R中,输入引用(PAA)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("PAA")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes (PAA)
R脚本 | PAA教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 分类,微阵列,OneChannel,蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.3.3 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | BSD_3_clause +文件LICENSE |
取决于 | R (> = 3.2.0),Rcpp(> = 0.11.6) |
进口 | e1071,limma,质量,mRMRe,randomForest,ROCR,股东价值分析 |
链接 | Rcpp |
建议 | BiocStyle,RUnit,BiocGenerics,vsn |
SystemRequirements | c++软件包随机丛林 |
增强了 | |
URL | http://www.medizinisches-proteom-center.de/PAA |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | PAA_1.3.3.tar.gz |
Windows二进制 | PAA_1.3.3.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | PAA_1.3.3.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | PAA_1.3.3.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/PAA/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/PAA/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: