要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("PAA")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

PAA

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PAA

蛋白质阵列分析仪

Bioconductor版本:3.1

PAA导入以gpr文件格式保存的单色(蛋白质)微阵列数据,特别是ProtoArray数据。在进行预处理(背景校正、批量过滤、归一化)后,进行单变量特征预选择(例如,使用“最小M统计量”方法——以下简称“mm”)。随后,进行多变量特征选择,以发现生物标志物候选。因此,既可以采用基于频率的反向消除方法,也可以采用集成特征选择。PAA提供了一个完整的分析工具工具箱,包括用于结果检查和评估的几个不同的图。

作者:Michael Turewicz [aut, cre], Martin Eisenacher [ctb, cre]

维护者:Michael Turewicz < Michael。turewicz at rub.de>, Martin Eisenacher < Martin。在rub.de eisenach >

引用(从R中,输入引用(PAA)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("PAA")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes (PAA)

PDF R脚本 PAA教程
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 分类微阵列OneChannel蛋白质组学软件
版本 1.3.3
Bioconductor自 BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 BSD_3_clause +文件LICENSE
取决于 R (> = 3.2.0),Rcpp(> = 0.11.6)
进口 e1071limma质量mRMRerandomForestROCR股东价值分析
链接 Rcpp
建议 BiocStyleRUnitBiocGenericsvsn
SystemRequirements c++软件包随机丛林
增强了
URL http://www.medizinisches-proteom-center.de/PAA
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 PAA_1.3.3.tar.gz
Windows二进制 PAA_1.3.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) PAA_1.3.3.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) PAA_1.3.3.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/PAA/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/PAA/
包下载报告 下载数据

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弗雷德·哈钦森癌症研究中心