##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("PathNet")

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本，请参见PathNet．

使用拓扑信息进行路径分析的R包

Bioconductor版本:3.1

PathNet利用存在于基因通路和差异表达水平的拓扑信息(从微阵列实验获得)来识别1)显著富集和2)在差异表达背景下相互关联的通路。该算法在:PathNet:一种使用拓扑信息进行路径分析的工具。Dutta B, Wallqvist A, Reifman J.生物与医学源代码2012年9月24日;7(1):10。

作者:Bhaskar Dutta < Bhaskar。dutta在gmail.com>， Anders Wallqvist ， Jaques Reifman

维护人员:Jason B. Smith

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("PathNet")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“PathNet”)

PDF	R脚本	PathNet
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，KEGG，MultipleComparison，网络，NetworkEnrichment，通路，软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 1.14.0)
进口
链接
建议	PathNetData，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	EnrichmentBrowser
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	PathNet_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	PathNet_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	PathNet_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队)	PathNet_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/PathNet/tree/release-3.1
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/PathNet/
包下载报告	下载数据