要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("Polyfit")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

Polyfit

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见Polyfit

添加到DESeq,以提高p值和q值

Bioconductor版本:3.1

Polyfit是DESeq包的一个附加项,它确保p值分布在区间[0,1]上是均匀的,对于满足无差分表达式的零假设的数据,它使用一种适应的story - tibshiran方法来计算q值。

作者:康拉德的负担

维护者:Conrad Burden < Conrad。负担在anu.edu.au >

引用(从R中,输入引用(“Polyfit”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("Polyfit")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“Polyfit”)

PDF R脚本 Polyfit
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionRNASeq测序软件
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 GPL (> = 3)
取决于 DESeq
进口
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 Polyfit_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 Polyfit_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) Polyfit_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) Polyfit_1.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/Polyfit/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/Polyfit/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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弗雷德·哈钦森癌症研究中心