要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“RMassBank”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见RMassBank.
Bioconductor版本:3.1
处理串联MS文件和构建MassBank记录的工作流。功能包括串联质谱的自动提取、串联质谱片段的公式分配、用指定片段重新校准串联质谱、谱清理、从互联网数据库中自动检索化合物信息以及导出到MassBank记录。
作者:Michael Stravs, Emma Schymanski, Steffen Neumann, Erik Mueller,由Tobias Schulze提供
维护者:RMassBank at Eawag
引文(从R内,输入引用(“RMassBank”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“RMassBank”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RMassBank”)
R脚本 | RMassBank非标准用法 | |
R脚本 | RMassBank使用XCMS演练 | |
R脚本 | RMassBank预排 | |
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
版本 | 1.10.0 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Rcpp |
进口 | XML,RCurl,rjson,rcdk,yaml,mzR、方法 |
链接 | |
建议 | gplots,RMassBankData,xcms(> = 1.37.1),相机,ontoCAT,RUnit |
SystemRequirements | OpenBabel |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | RMassBankData |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | RMassBank_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | RMassBank_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | RMassBank_1.10.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | RMassBank_1.10.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/RMassBank/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/RMassBank/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: