要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“SPIA”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SPIA

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见SPIA

信号通路影响分析(SPIA)使用通路过度表达和异常信号扰动的联合证据

Bioconductor版本:3.1

该软件包实现了信号通路影响分析(SPIA),该分析使用差异表达基因及其对数折叠变化以及信号通路拓扑结构的信息,以确定与研究条件最相关的通路。

作者:Adi Laurentiu Tarca , Purvesh Kathri < Purvesh at cs.wayne.edu>和Sorin Draghici < Sorin at wayne.edu>

维护者:Adi Laurentiu Tarca

引文(从R内,输入引用(“SPIA”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“SPIA”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SPIA”)

PDF R脚本 SPIA
PDF 参考手册

细节

biocViews GraphAndNetwork,微阵列,软件
版本 2.20.0
在Bioconductor BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 2.14.0),图形,KEGGgraph
进口 图形
链接
建议 ,Rgraphviz,hgu133plus2.db
SystemRequirements
增强了
URL http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btn577v1
全靠我
进口我 EnrichmentBrowser
建议我 石墨,KEGGgraph
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 SPIA_2.20.0.tar.gz
Windows二进制 SPIA_2.20.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) SPIA_2.20.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) SPIA_2.20.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/SPIA/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/SPIA/
软件包下载报告 下载数据

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R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

弗雷德哈钦森癌症研究中心