# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite(“斯坦”)

这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅斯坦。

STrand-specific基因组数据的注释

Bioconductor版本:3.1

斯坦(STrand-specic注释基因组数据)实现双向隐马尔可夫模型(bdHMM),用于研究指导基因组进化过程,如基因转录、DNA复制、重组或DNA修复通过整合基因组数据。bdHMMs模型连续观测序列(如芯片或沿着基因组RNA测量)通过一个离散的“定向基因状态”,如反映不同的genome-associated复合物。与标准HMM方法不同,bdHMMs允许集成strand-specific(例如RNA)和非strand-specific数据(例如芯片)。

作者:Benedikt米基罗,朱利安Gagneur Achim Tresch

维护人员:Benedikt米基罗<米基罗在lmb.uni-muenchen.de >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite(“斯坦”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“斯坦”)

PDF	R脚本	STrand-specific基因组数据的注释
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GenomeAnnotation,HiddenMarkovModel,微阵列,测序,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(1.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	Rsolnp、方法
进口
链接
建议	BiocStyle,Gviz,GenomicRanges,IRanges,gplots,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	STAN_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	STAN_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	STAN_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	STAN_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/stan/tree/release - 3.1
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/STAN/
包下载报告	下载数据