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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ biomart”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅Biomart。
生物导体版本:3.1
近年来,公共数据存储库已获得大量生物学数据。对于全面的生物信息学数据分析,需要轻松访问这些有价值的数据资源和与数据分析的公司集成。BIOMART提供了越来越多的数据库集合的接口,该数据库实施了Biomart软件套件(http://www.biomart.org)。该软件包可以以统一的方式检索大量数据,而无需了解基础数据库模式或编写复杂的SQL查询。BiomArt数据库的示例是Ensembl,Cosmic,Uniprot,HGNC,Gramene,Wormene,Wormbase和DBSNP映射到Ensembl。这些主要数据库使BiomArt用户可以直接访问各种数据集,并启用从基因注释到数据库挖掘的广泛强大的在线查询。
作者:steffen durinck
维护者:steffen durinck
引用(从r内,输入引用(“ Biomart”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Biomart”)
R脚本 | BIOMART用户指南 | |
参考手册 |
生物浏览 | 注解,,,,软件 |
版本 | 2.24.1 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 11年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 方法 |
进口 | utils,XML,,,,rcurl,,,,AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | 注释 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | Chippeakanno,,,,彗星,,,,CustomProdb,,,,达格洛戈,,,,域名,,,,drugvsdisease,,,,Fletcher2013b,,,,Genefu,,,,基因组,,,,米尼卡,,,,诗篇,,,,Roleswitch,,,,寿司,,,,vegamc |
进口我 | arrayexpresshts,,,,Cobindr,,,,CustomProdb,,,,dexseq,,,,doqtl,,,,EasyRnaseq,,,,富集兄弟,,,,GenomicFeatures,,,,gesper,,,,goexpress,,,,GVIZ,,,,HTSANALYZER,,,,IDMappingRetRieval,,,,keggprofile,,,,Medips,,,,metagene,,,,metaseqr,,,,甲基分析,,,,负鼠,,,,PBase,,,,表,,,,proloc,,,,杂种,,,,R453plus1toolbox,,,,RGSEPD,,,,rnaither,,,,rnaseqsamples,,,,seq2pathway,,,,seqgsea |
建议我 | 生物探测,,,,CCTORIAL,,,,DegReport,,,,Geneanswers,,,,Genominator,,,,H5VC,,,,isobar,,,,Leebamviews,,,,Massir,,,,米尼卡,,,,幻影,,,,奥利戈,,,,奥利戈,,,,Onechannelgui,,,,Paxtoolsr,,,,钢琴,,,,R3CPET,,,,rcade,,,,rforpoteomics,,,,Ripseeker,,,,rnaseqtutorial,,,,rnbeads,,,,rtandem,,,,rtrm,,,,Shortread,,,,SIM,,,,辛克尔,,,,Systempiper,,,,TrackViewer |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | biomart_2.24.1.tar.gz |
Windows二进制 | biomart_2.24.1.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | biomart_2.24.1.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | biomart_2.24.1.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/biomart/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/biomart/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |