要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“chipenrich”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见chipenrich.
Bioconductor版本:3.1
ChIP-Enrich使用来自ChIP-seq实验的峰进行基因集富集测试。该方法对基因长度、基因周围序列的可映射性等混杂因素进行了经验校正。
作者:Ryan P. Welch [aut, cre, cph], Chee Lee [aut, cre], Raymond G. Cavalcante [aut, cre], Laura J. Scott [ths], Maureen A. Sartor [ths]
维护者:Ryan P. Welch
引文(从R内,输入引用(“chipenrich”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“chipenrich”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“chipenrich”)
R脚本 | ChIP-Enrich装饰图案/教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,浓缩,GeneSetEnrichment,软件 |
版本 | 1.6.1 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.15.1) |
进口 | chipenrich.data、方法、GenomicRanges(> = 1.10.0),IRanges(> = 1.16.0),mgcv,plyr(> = 1.7.0),晶格,latticeExtra、网格stringr(> = 0.6),rms |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行 |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | chipenrich_1.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | chipenrich_1.6.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | chipenrich_1.6.1.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | chipenrich_1.6.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/chipenrich/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/chipenrich/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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