要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“chipenrich”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

chipenrich

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见chipenrich

ChIP-seq峰值数据的基因集富集

Bioconductor版本:3.1

ChIP-Enrich使用来自ChIP-seq实验的峰进行基因集富集测试。该方法对基因长度、基因周围序列的可映射性等混杂因素进行了经验校正。

作者:Ryan P. Welch [aut, cre, cph], Chee Lee [aut, cre], Raymond G. Cavalcante [aut, cre], Laura J. Scott [ths], Maureen A. Sartor [ths]

维护者:Ryan P. Welch , Chee Lee , Raymond G. Cavalcante

引文(从R内,输入引用(“chipenrich”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“chipenrich”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“chipenrich”)

PDF R脚本 ChIP-Enrich装饰图案/教程
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学浓缩GeneSetEnrichment软件
版本 1.6.1
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.15.1)
进口 chipenrich.data、方法、GenomicRanges(> = 1.10.0),IRanges(> = 1.16.0),mgcvplyr(> = 1.7.0),晶格latticeExtra、网格stringr(> = 0.6),rms
链接
建议
SystemRequirements
增强了 平行
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 chipenrich_1.6.1.tar.gz
Windows二进制 chipenrich_1.6.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) chipenrich_1.6.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) chipenrich_1.6.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/chipenrich/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/chipenrich/
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