要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“chromDraw”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

chromDraw

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见chromDraw

chromDraw用于线性和圆形核型可视化的R包。

Bioconductor版本:3.1

包chromDraw是一个简单的包用于线性和圆形的核型可视化。线性型可视化通常用于显示核型中的染色体结构,圆形型可视化用于彼此之间的核型比较。该工具有自己的输入数据格式或基因组范围结构可以作为输入。每条染色体包含着丝块的定义和着丝粒的位置。输出文件格式为*。Eps和*.svg。

作者:Jan Janecka, Ing。,经理马萨里克大学

维护者:Jan Janecka < Jan。Janecka在ceitec.muni.cz>

引文(从R内,输入引用(“chromDraw”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“chromDraw”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“chromDraw”)

PDF R脚本 chromDraw
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 软件
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.0.0)
进口 Rcpp(> = 0.11.1),GenomicRanges(> = 1.17.46)
链接 Rcpp
建议
SystemRequirements Rtools (>= 3.1)
增强了
URL www.plantcytogenomics.org/chromDraw
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 chromDraw_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 chromDraw_1.0.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) chromDraw_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) chromDraw_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/chromDraw/tree/release-3.1
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/chromDraw/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

弗雷德哈钦森癌症研究中心