要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“chromDraw”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见chromDraw.
Bioconductor版本:3.1
包chromDraw是一个简单的包用于线性和圆形的核型可视化。线性型可视化通常用于显示核型中的染色体结构,圆形型可视化用于彼此之间的核型比较。该工具有自己的输入数据格式或基因组范围结构可以作为输入。每条染色体包含着丝块的定义和着丝粒的位置。输出文件格式为*。Eps和*.svg。
作者:Jan Janecka, Ing。,经理马萨里克大学
维护者:Jan Janecka < Jan。Janecka在ceitec.muni.cz>
引文(从R内,输入引用(“chromDraw”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“chromDraw”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“chromDraw”)
R脚本 | chromDraw | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.0.0) |
进口 | Rcpp(> = 0.11.1),GenomicRanges(> = 1.17.46) |
链接 | Rcpp |
建议 | |
SystemRequirements | Rtools (>= 3.1) |
增强了 | |
URL | www.plantcytogenomics.org/chromDraw |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | chromDraw_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | chromDraw_1.0.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | chromDraw_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | chromDraw_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/chromDraw/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/chromDraw/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: