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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“customProDB”)
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customProDB
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这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅customProDB。
从门店数据生成定制的蛋白质数据库,重点RNA-Seq数据,为蛋白质组学搜索。
Bioconductor版本:3.1
蛋白质组学从RNA-Seq生成定制的蛋白质序列数据库数据搜索
作者:小菁王
维护人员:小菁王<小菁。王在vanderbilt.edu >
从内部引用(R,回车引用(“customProDB”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“customProDB”)
文档
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browseVignettes (“customProDB”)
| R脚本 | 介绍customProDB | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing,MassSpectrometry,蛋白质组学,RNASeq,单核苷酸多态性,软件,转录 |
| 版本 | 1.8.2 |
| Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.0.1),IRanges,AnnotationDbi,biomaRt |
| 进口 | IRanges,GenomicRanges,Rsamtools(> = 1.10.2),GenomicAlignments,Biostrings(> = 2.26.3之前),GenomicFeatures(> = 1.17.13),biomaRt(> = 2.17.1),stringr,RCurl,plyr,VariantAnnotation(> = 1.13.44),rtracklayer,RSQLite,AnnotationDbi |
| 链接 | |
| 建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | customProDB_1.8.2.tar.gz |
| Windows二进制 | customProDB_1.8.2.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | customProDB_1.8.2.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | customProDB_1.8.2.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/customprodb/tree/release - 3.1 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/customProDB/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
